關于鼠尸的處理方法與滅鼠方法有直接的關系，比如說如果防治的場所適合只用物理滅鼠法就可以滅除大部分的老鼠，那么關于鼠尸的處理問題就非常簡單了，現場消滅直接處理或直接把粘住老鼠的粘鼠板進行更換即可。但是對于化學滅鼠法或物理化學復合滅鼠法，鼠尸處理就比較有講究了。
首先，對于投放滅鼠劑和粘鼠板、鼠夾等藥械的布放點，要進行認真記錄，在滅鼠作業施工結束后的15天之內（死亡的高峰期應該是在第4天至第8天），應該每天檢查各布放點的現狀，觀察滅鼠器械的捕鼠情況，如果有死鼠及時揀出。然后檢查能夠查看到的所有犄角旮旯、管道、天花板上，看到有鼠尸及時揀出，一定要放在密封的塑料袋里。
其次，是注意衛生防疫的問題，在發現死鼠的地點及周邊環境用殺蟲劑進行噴灑，另外操作人員應注意個人的防護，穿防護服、戴橡皮手套、戴口罩，用鑷子將鼠尸夾起，絕對不能用裸手操作。
再次，是鼠尸的最后處理，一定不能將裝有鼠尸的袋子直接扔進垃圾桶里，應該在離開城市生活密集區2公里的范圍以外的地方進行焚燒或者深埋處理。
